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1. Abra um documento PDF, abra o menu Ferramentas e ache a opção Certificados.

2. Clique em Assinar Digitalmente e selecione uma área do PDF para colocar a Assinatura, sendo a primeira vez um menu para Configurar a ID Digital vai abrir.

3. Clique em Usar uma ID digital de um arquivo.

4. Clique em procurar e ache a pasta em que você salvou o seu Certificado Digital, clique no arquivo e digite a senha do Certificado, após isso clique em Continuar.

5. Escolha o a ID digital que você quer utilizar e clique em Continuar.

6. Insira a senha do Certificado no Campo que solicita e clique em Assinar.

Atenção: O botão assinar só fica disponível após a senha ser digitada.

Obs: A opção Bloquear o Documento depois de Assinar permite que ninguém mais seja capaz de assinar, uma importante opção de segurança, só lembre que em documentos com múltiplas assinaturas necessárias somente a última pessoa deve marcar essa opção.